Fazerilla on oma mylly, joka jauhaa Fazerin leipiin erilaiset jauhot ja seokset tarpeen mukaan. Siksi meillä on aina käytettävissämme juuri sellaisia jauhoja kuin haluamme, silloin kun haluamme.
Fazerin leipiin käytetään vain myllytuoreita jauhoja. Fazer Mylly asettaa vastaanotettavalle viljalle tarkat laatuvaatimukset ja laadunvalvonta on tiukka.
Laatutarkastettu vilja saapuu myllylle, jossa se esipuhdistetaan, luokitellaan ja valmennetaan jauhatusta varten. Jyvät rouhitaan, seulotaan ja lajitellaan eri jauhatuskarkeuksiin. Samoista jyvistä siis tehdään erilaisia jauhoja ja jauhoseoksia. Laadunvalvonta on mukana joka prosessin vaiheessa, jolloin voidaan taata laadukkaat jauhot. Vain laadukkaista raaka-aineista voidaan leipoa laadukasta leipää.
Oma mylly mahdollistaa tuoteinnovaatiot, kuten Fazer Ruiskuitu, jonka avulla vaaleaan leipään voidaan lisätä rukiin terveelliset ominaisuudet. Vuoden 2006 Suomalainen elintarvike Fazer Ruistoast on ensimmäinen leipä, jossa innovaatiota on hyödynnetty.