Keliakia ja FODMAP eivät liity toisiinsa.

Keliakia on autoimmuunisairaus, jossa ravintoaineiden imeytymiselle välttämätön ohutsuolen suolinukka tuhoutuu vehnän, ohran ja rukiin sisältämän gluteeni-proteiinin toimesta. Keliaakikot noudattavat täysin gluteenitonta ruokavaliota, jossa ruokavaliosta karsitaan kokonaan gluteenia sisältävät viljat ja viljatuotteet. Gluteeniton ruokavalio on keliaakikon suoliston ja siten koko elimistön toiminnalle välttämätön. Gluteenia ei kuitenkaan tulisi karsia ruokavaliosta, mikäli siihen ei ole terveydellistä tarvetta.

FODMAP-ruokavaliossa karsitaan pois tai vähennetään FODMAP-hiilihydraatit. Monestikaan FODMAP-hiilihydraattien karsimisen ei tarvitse olla täydellistä, vähentäminen riittää. Gluteenittomat tuotteet soveltuvat monesti, eivät aina, FODMAP-ruokavalioon niissä käytetyn raaka-ainepohjan ansiosta.